Nunchuk-apuohjain on suunniteltu sopimaan täydellisesti pelaajan käteen. Nunchuk-apuohjain sisältää samaa liikkeentunnistusteknologiaa kuin Wii Remote-ohjain ja lisäksi siinä on analoginen ohjainsauva. Useimmissa Wiin peleissä pelaajat voivat käyttää Nunchuk-apuohjaimen analogista ohjainsauvaa pelihahmojen ohjaamisessa ja Wii Remote-ohjainta suorittaakseen tiettyjä toimintoja, kuten pallon syöttäminen jalkapallopelissä tai aseella tähtääminen toimintapelissä. Tämä laite ei ole Nintendon valmistama mutta täysin vastaava.