Rajoitettu erä Skyward Sword -teemalla varustettuja Joy-Con -ohjaimia julkaistaan myös samana päivänä kuin itse peli. Oikeanpuoleisen Joy-Con -ohjaimen teemana on Master Sword ja vasemmanpuoleisen Joy-Con -ohjaimen teemana on Hylian Shield. Lisää enemmän pelaajia yhteensopiviin peleihin Joy-Con -lisäohjainparilla. Koe täysin uudenlaisia pelitapoja! Tässä pelin parannetussa versiossa, joka pyörii tasaisesti 60 framea sekunnissa, voit valita pelaatko liikeohjauksella kahdella Joy-Con -ohjaimella samalla tavalla kuin alkuperäisessä versiossa.